¿Cuál es la diferencia entre LÍNEAS y SENO?

Que Diferencia clave entre LÍNEAS y SINE es que los LINE (núcleos intercalados largos) son un tipo de retrotransposones no LTR más largos, mientras que los SINE (núcleos intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones no LTR mucho más cortos.

Los retrotransposones que no son LTR no contienen repeticiones terminales largas (LTR). Sin embargo, contienen genes para la transcriptasa inversa, la proteína de unión al ARN, la nucleasa y el dominio H de la ribonucleasa. Los retrotransposones que no son LTR tienen repeticiones cortas. Estas repeticiones tienen una disposición invertida de bases una al lado de la otra. Aparte de eso, los retrotransposones que no son LTR también tienen repeticiones directas que se encuentran en los transposones LRT. Los retrotransposones que no son LTR se dividen en dos categorías como LINE y SINE.

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CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué son las LÍNEAS?
3. ¿Qué son las ondas sinusoidales?
4. Similitudes - LÍNEAS vs. SENO
5. LÍNEAS vs. SENO en forma tabular
6. Resumen

¿Qué son las LÍNEAS?

Los LINE (elementos nucleares intercalados largos) son retrotransposones no LTR más largos. Están muy extendidos en el genoma de los eucariotas. Normalmente constituyen el 21,1% del genoma humano. Cada LÍNEA tiene una longitud aproximada de 7000 pares de bases. Los LINE pueden transcribirse en ARNm y traducirlo en una proteína que puede funcionar como una enzima transcriptasa inversa. Esta transcriptasa inversa produce copias de ADN del ARN de LINE. Estas copias de ADN se pueden integrar en el genoma en una nueva ubicación.

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Figura 01: LÍNEAS y SENOS

El genoma humano tiene un solo LINAJE abundante llamado LINAJE-1. El elemento LINE-1 tiene una longitud aproximada de 6000 pares de bases. Hay aproximadamente 100.000 elementos LINE-1 truncados en el genoma humano. Pueden ocurrir mutaciones aleatorias en LINE. Debido a mutaciones aleatorias, las LÍNEAS pueden degenerar. Ya no se transcribirán ni traducirán. Además, las LÍNEAS se clasifican en cinco grupos principales, como L1, RTE, R2, I y Jockey. Estos cinco grupos se dividen a su vez en otros 28 clados.

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Los LINE generalmente se propagan a través de un mecanismo llamado mecanismo de transcripción inversa cebado por destino (TPRT). La inserción de LINE provoca enfermedades humanas como hemofilia A, cáncer, trastornos mendelianos, etc. La hipometilación de LINE también induce ciertos tipos de cáncer.

¿Qué son los SINE?

Los SINE (elementos nucleares intercalados cortos) son un tipo de retrotransposones no LTR mucho más cortos. Tienen entre 100 y 700 pares de bases de largo. Los SINE también son elementos de ADN que se amplifican a través de genomas eucarióticos a través de intermediarios de ARN. Los SINE constituyen aproximadamente el 13% del genoma de los mamíferos. Las regiones internas de los SINE se derivan del ARNt. Sigue estando muy conservado. A menudo están presentes en muchas especies de vertebrados e invertebrados. La variación del número de copias y las mutaciones en los SINE se pueden incluir para crear la clasificación de especies basada en la filogenia.

Los SINE se pueden clasificar en tres tipos principales: CORE-SINE, V-SINE y AmnSINE. El elemento Alu es el SINE más común en los primates. Además, existen más de 50 enfermedades humanas asociadas a la inserción de SINE. Cuando se insertan dentro o cerca de los exones, pueden provocar un empalme inadecuado o alterar el marco de lectura. Esto conduce a fenotipos de enfermedades como cáncer de mama, cáncer de colon, leucemia, hemofilia, fibrosis quística, cáncer de colon, enfermedad de Dent, neurofibromatosis, etc.

¿Cuáles son las similitudes entre LINES y SINE?

• LINE y SINE son dos tipos de retrotransposones no LTR.
• Ambos no tienen regiones finales largas (LTR).
• Ambos se encuentran predominantemente solo en eucariotas.
• Ninguno de los dos es autónomo.

¿Cuál es la diferencia entre LÍNEAS y SENO?

Los LINE son retrotransposones no LTR más largos, mientras que los SINE son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Entonces, esta es la diferencia clave entre LINE y SINE. Además, LINES codifica la enzima transcriptasa inversa mientras que SINE no codifica la enzima transcriptasa inversa. Así que esta es otra diferencia entre LINEs y SINES.

Otras diferencias entre LINE y SINE se tabulan a continuación para una comparación directa.

Resumen - LÍNEAS vs. SINE

Los retrotransposones se encuentran principalmente en todos los eucariotas, pero están ausentes en los procariotas. Alrededor del 37% del genoma humano contiene retrotransposones. Los retrotransposones son principalmente de dos tipos: retrotransposones LTR y no LTR. Los retrotransposones que no son LTR no contienen las repeticiones terminales largas (LTR) que están presentes en los retrotransposones LTR. Los retrotransposones que no son LTR se dividen además en dos categorías: LINE y SINE. Los LINE son retrotransposones no LTR más largos, mientras que los SINE son retrotransposones no LTR mucho más cortos. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre LINE y SINE.

Relación:

1. "Retrotransposón". Una visión general | Temas de ScienceDirect.
2. Hancks, Dustin C. y Haig H. Kazazian. "Roles de las inserciones de retrotransposones en enfermedades humanas". ADN móvil, BioMed Central, 6 de mayo de 2016.

Imagen de cortesía:

1. "LINE1s and SINEs" por Mariuswalter - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia