¿Cuál es la diferencia entre la secuencia Shine Dalgarno y Kozak?

Que diferencia principal entre Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak es que la secuencia de Shine-Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en los ARN mensajeros bacterianos y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos.

Las secuencias Shine-Dalgarno y Kozak son dos secuencias consenso muy importantes para el inicio de la traducción. En biología molecular, la traducción es el proceso por el cual los ribosomas en el citoplasma sintetizan proteínas después del proceso de transcripción. Durante la traducción, se decodifica un ARNm (ARN mensajero) en un ribosoma para producir una cadena específica de aminoácidos fuera del núcleo celular. Por lo general, un ribosoma induce el proceso de decodificación al facilitar la unión de secuencias de anticodón de ARNt complementarias a codones de ARNm. La traducción ocurre en tres etapas: iniciación, elongación y terminación.

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CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es la secuencia Shine-Dalgarno?
3. ¿Qué es la sucesión de Kozak?
4. Similitudes: secuencia de Shine Dalgarno y Kozak
5. Shine Dalgarno vs. Kozak secuencia en forma tabular
6. Resumen - Secuencia Shine Dalgarno vs. Kozak

¿Qué es la secuencia Shine-Dalgarno?

La secuencia Shine-Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en el ARN mensajero bacteriano y arqueal. Generalmente se ubica unas 8 bases corriente arriba del codón de inicio AUG. Esta secuencia de ARN ayuda a reclutar ribosomas para el ARN mensajero al alinear el ribosoma con un codón de inicio de ARNm. Por lo tanto, inicia la síntesis de proteínas. Una vez reclutado, el tRNA puede agregar aminoácidos en el orden dictado por los codones del mRNA. Esta secuencia particular es común en las bacterias pero más rara en las arqueas. Además, también está presente en los transcritos de cloroplastos y mitocondrias. La secuencia Shine-Dalgarno fue propuesta por primera vez por los científicos australianos John Shine y Lynn Dalgarno. La secuencia consenso de seis bases es AGGAGG. por ejemplo en Escherichia coli el resultado es AGGAGGU.

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Figura 01: Secuencia Shine-Dalgarno

La selección del sitio de iniciación (AUG) depende de la interacción entre la subunidad 30S del ribosoma y la plantilla de ARNm. La región rica en pirimidina en el componente 16srRNA de la subunidad 30S se une a la región rica en purina conocida como secuencia Shine-Dalgarno cadena arriba del codón de iniciación AUG en el ARNm. Además, durante la formación del complejo de iniciación, estas secuencias de nucleótidos complementarias se emparejan para formar una estructura de ARN de doble cadena. Esto facilita la unión del ARNm a un ribosoma de manera que el codón de iniciación se coloca en el sitio P del ribosoma.

¿Qué es la sucesión de Kozak?

La secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARNm eucarióticos. Esta secuencia también se denomina secuencia consenso de Kozak. La secuencia de Kozak es la secuencia óptima para iniciar la traducción en eucariotas. Esta secuencia es un aspecto integral de la regulación de proteínas. También es muy importante para la salud celular en general. Ayuda a corregir la traducción de proteínas de mensajes genéticos al mediar en el ensamblaje de ribosomas y el inicio de la traducción.

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Figura 02: secuencia Kozak

Esta secuencia lleva el nombre de la científica que la descubrió, Marilyn Kozak. Lo descubrió a través de un análisis detallado de las secuencias del genoma del ADN. La secuencia de Kozak es 5' (gcc) gccRccAUGG-3'. Las letras mayúsculas indican bases conservadas, mientras que las letras minúsculas indican bases variables comunes. R denota una purina (adenina o guanina) que siempre está en esta posición.

¿Cuáles son las similitudes entre Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak?

• Las secuencias Shine-Dalgarno y Kozak son dos secuencias consenso muy importantes en el inicio de la traducción.
• Ambos son secuencias de ARN.
• La subunidad más pequeña del ribosoma se une a ambas secuencias.
• Ambas secuencias median el ensamblaje de ribosomas adecuado y el inicio de la traducción.
• Son aspectos integrales de la regulación de proteínas y la salud celular en general.

¿Cuál es la diferencia entre la secuencia Shine Dalgarno y Kozak?

La secuencia de Shine-Dalgarno es un sitio de unión ribosómico que se encuentra en el ARN mensajero bacteriano y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas que se encuentra en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos. Esta es la principal diferencia entre Shine Dalgarno y la secuencia de Kozak. Además, la secuencia de Shine-Dalgarno es 5'AGGAGGU3' mientras que la secuencia de Kozak es 5' (gcc) gccRccAUGG-3'.

La siguiente infografía enumera las diferencias entre las secuencias de Shine Dalgarno y Kozak en forma tabular para una comparación directa.

Resumen - Shine Dalgarno vs. Kozak Secuencia

Las secuencias de Shine Dalgarno y Kozak son dos secuencias de ARN consenso que son muy importantes para el ensamblaje de los ribosomas y el inicio de la traducción. La secuencia de Shine-Dalgarno es un sitio de unión ribosómica en el ARN mensajero bacteriano y de arqueas, mientras que la secuencia de Kozak es un sitio de iniciación de la traducción de proteínas en la mayoría de los ARN mensajeros eucarióticos. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre las secuencias Shine Dalgarno y Kozak.

Relación:

1. "Secuela de Shine-Dalgarno". Una visión general | Temas de ScienceDirect.
2. "Secuencia de consenso de Kozak". Una visión general | Temas de ScienceDirect.

Imagen de cortesía:

1. "Secuencias Shine-Dalgarno" de Shakiestone. Versión en español de Alejandro Porto - Archivo: Shine-Dalgarno secuencia.png (CC BY-SA 3.0) vía Commons Wikimedia
2. "Reglamento de traducción por elementos cis líderes de transcripción 5'" Por Apfel412 - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia