¿Cuál es la diferencia entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas?

Que diferencia principal entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas es que el perfilado de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas utilizando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfilado de ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas utilizando solo la secuencia de ARNm durante la traducción.

La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas, convirtiendo la información del ARNm en una secuencia de aminoácidos. Translatomics es un estudio de ORF (marcos abiertos de lectura) que se traducen activamente en una célula de un organismo. Las técnicas de perfilado de polisomas y ribosomas son dos tipos de técnicas en el campo de la biología molecular para evaluar e inferir varios parámetros relacionados con el análisis del traductor.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es el perfilado de polisomas?
3. ¿Qué es el perfilado de ribosomas?
4. Similitudes: perfilado de polisomas y perfilado de ribosomas
5. Perfilado de polisomas frente a perfilado de ribosomas en forma tabular
6. Resumen: perfilado de polisomas frente a perfilado de ribosomas

¿Qué es el perfilado de polisomas?

El perfilado de polisomas es una técnica que infiere el estado de traducción de un ARNm determinado mediante el análisis del comportamiento tanto del ribosoma como del ARNm (polisoma). En otras palabras, esta técnica proporciona datos y conclusiones sobre la asociación de mRNAs con ribosomas. El polisoma se refiere al grupo de ribosomas unidos a un ARNm presente durante la fase de elongación de la traducción.

Figura 01: perfilado de polisomas

El perfilado de polisomas requiere el lisado celular, que luego se centrifuga. Luego, la muestra centrifugada se separa en función de su densidad para caracterizar las subunidades pequeñas y grandes del ribosoma y el ARNm correspondiente involucrado en la formación del polisoma. Además, el método también incluye la medición de la densidad óptica. Se requieren expertos para el perfilado de polisomas.

La técnica de perfilado de polisomas es una herramienta importante para muchas aplicaciones. Los científicos usan esta técnica para estudiar el grado de traducción en las células. Más específicamente, es una herramienta para proporcionar información precisa sobre el estudio de proteínas individuales y sus ARNm específicos. En el contexto del estudio del grado de traducción de un ARNm dado, la técnica de perfilado de polisomas es de crucial importancia. Las secuencias 3' y 5' de un ARNm pueden examinarse con respecto a sus efectos sobre la cantidad de ARNm producido y el nivel de traducción.

¿Qué es el perfilado de ribosomas?

El perfilado de ribosomas es una técnica que analiza el comportamiento del ribosoma en relación con su ARNm durante la traducción. Esta técnica fue descubierta y desarrollada por Joan Steitz y Marilyn Kozak. Posteriormente, esta tecnología fue desarrollada por dos científicos, Nicholas y Jonathan, en combinación con la secuenciación de próxima generación, lo que condujo al desarrollo de varias técnicas relacionadas, como

Figura 02: Secuenciación de ribosomas

El proceso de perfilado de ribosomas implica aislar el ARNm, eliminar el ARN que no está unido a los ribosomas y separar el ARNm unido a los ribosomas. Después de este procedimiento, el aislado de ARNm se transcribe de forma inversa y tiene lugar la síntesis de ADNc. Finalmente, los datos de la secuencia se pueden comparar con el perfil de traducción para inferir las características del comportamiento de los ribosomas con respecto al ARNm.

El perfil de ribosomas ayuda a muchos investigadores a identificar e inferir la ubicación de los sitios de inicio de la traducción, el complemento de los marcos abiertos de lectura (ORF) traducidos en una célula o tejido, la distribución de los ribosomas en el ARNm y la tasa de traducción de los ribosomas. El perfilado de ribosomas también se conoce como huella de ribosomas o Ribo Seq.

¿Cuáles son las similitudes entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas?

• El perfilado de polisomas y ribosomas son técnicas de biología molecular que son importantes en la investigación.
• Proporcionan información sobre el proceso de traducción.
• Ambos procesos de creación de perfiles proporcionan datos mediante el análisis del traductor.
• Se requieren expertos profesionales para realizar ambas técnicas para obtener resultados precisos.
• Las herramientas bioinformáticas juegan un papel importante en ambos métodos.

¿Cuál es la diferencia entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas?

El perfilado de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfilado de ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando solo la secuencia de ARNm durante la traducción. Entonces, esta es la diferencia clave entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas. Además, el perfilado de polisomas incluye técnicas como la centrifugación en gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica, mientras que el perfilado de ribosomas incluye técnicas de extracción y secuenciación de ARNm. Además, el perfilado de ribosomas es más preciso que el perfilado de polisomas.

La siguiente infografía muestra las diferencias entre los perfiles de polisomas y ribosomas en forma tabular para una comparación directa..

Resumen: perfilado de polisomas frente a perfilado de ribosomas

La traducción es la segunda fase de la síntesis de proteínas, en la que la información sobre la secuencia de ARNm se convierte en una secuencia de aminoácidos. Este proceso requiere una plantilla de ARNm, ribosomas, aminoácidos, ARNt y otros factores. El perfilado de polisomas y ribosomas son dos técnicas moleculares. El perfilado de polisomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando tanto el ribosoma como el ARNm (polisoma) durante la traducción, mientras que el perfilado de ribosomas analiza el comportamiento de los ribosomas usando solo la secuencia de ARNm durante la traducción. El perfilado de polisomas incluye técnicas como la centrifugación en gradiente de densidad y las mediciones de densidad óptica. El perfilado de ribosomas incluye técnicas como la extracción de ARNm, la síntesis de ADNc y la secuenciación. Así que esto resume la diferencia entre el perfilado de polisomas y el perfilado de ribosomas.

Relación:

1. Chassé, Héloïse, et al. "Análisis de traducción utilizando perfiles de polisomas". Investigación de ácidos nucleicos, 2016.
2. Jin, Hyun Yong y Changchun Xiao. "Un método integrado de perfilado de polisomas y perfilado de ribosomas para estudiar el traductor in vivo". Métodos en Biología Molecular, 2017, pp. 1-18., https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7514-3_1.

Imagen de cortesía:

1. "Técnicas transatómicas importantes" por Polyribosomes - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "RibosomeProfilejpg" por DennisPietras - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia