¿Cuál es la diferencia entre ITS1 y ITS2?

Que diferencia principal entre ITS1 y ITS2 es que ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas.

El espaciador transcrito internamente (ITS) es el ADN espaciador normalmente ubicado entre los genes de ARN ribosomal de subunidad pequeña y los genes de ARN ribosomal de subunidad grande en el cromosoma o en la región transcrita correspondiente en la molécula de transcripción precursora de ARNr policistrónico. En bacterias y arqueas solo hay un único ITS entre los genes 16S y 23S rRNA. Pero en eucariotas hay dos ADN espaciadores ITS: ITS1 (entre los genes 18S y 5.8S rRNA) e ITS2 (entre 5.8S y 28S rRNA). Por lo tanto, ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciadores que se encuentran entre los genes de ARNr en eucariotas.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es ITS1?
3. ¿Qué es ITS2?
4. Similitudes - ITS1 e ITS2
5. ITS1 vs. ITS2 en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es ITS1?

ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas. ITS se refiere a una pieza de ADN espaciador no funcional que se encuentra entre los genes de ARNr. ITS1 tiene una mayor variación de longitud que ITS2. La variación de longitud de ITS1 es de aproximadamente (200-300 pb). Los marcadores ITS como ITS1 han demostrado su eficacia para dilucidar las relaciones filogenéticas entre diferentes taxones. Además, el ADN espaciador ITS1 está menos conservado que el ADN espaciador ITS2. Las estructuras ITS1 solo se conservan en unidades taxonómicas mucho más pequeñas. Cada grupo ribosómico eucariótico también contiene regiones denominadas espaciadores transcritos externos (5' y 3' ETS).

Figura 01: región ITS1

El ADN del espaciador ITS1 está muy cerca del espaciador transcrito externamente en 5' (5'-ETS). Además, si se desea amplificar la región ITS1 para estudios de relación filogenética, es necesario utilizar un par de cebadores específicos (cebadores inversos y directos) para este propósito. Para amplificar la región ITS1, normalmente se utilizan dos conjuntos de cebadores en los protocolos de PCR de laboratorio. Son ITS1 adelante e ITS2 atrás, o ITS1 adelante e ITS4 atrás.

¿Qué es ITS2?

ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas. La región ITS2 tiene una variación de longitud más corta que la región ITS1. La variación de longitud de ITS2 es de aproximadamente (180-240 pb). Sin embargo, la región ITS2 está más conservada que la región ITS1 en muchas unidades taxonómicas. Identifica que todas las secuencias ITS2 comparten un núcleo común de estructura secundaria. Además, el 40 % de la región ITS2 se conserva entre todas las angiospermas, mientras que es posible apuntar al 50 % de la región ITS2 entre familias y niveles superiores.

Figura 02: región ITS2

Independientemente del grado de conservación, el uso de la región ITS2 también es muy popular, como B. la región ITS1, en estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en códigos de barras de ADN fúngico. Un conjunto específico de cebadores se usa comúnmente en los protocolos de PCR de laboratorio para amplificar la región ITS2. Eso es ITS1 hacia adelante e ITS4 hacia atrás. Pero cuando el protocolo PCR usa este conjunto de cebadores, también amplifica la región ITS1 junto con la región ITS2. Además, el ADN del espaciador ITS2 está muy cerca del espaciador transcrito externamente en 3' (3'-ETS).

Similitudes entre ITS1 e ITS2

• ITS1 e ITS2 son dos ADN espaciadores ubicados entre los genes de ARNr.
• Solo se encuentran en eucariotas.
• Ambos pueden amplificarse utilizando pares de cebadores específicos.
• Ambos se eliminan como subproductos no funcionales durante la maduración del ARNr.
• Ambos son muy importantes para los estudios de relaciones filogenéticas, especialmente en los códigos de barras del ADN fúngico.

Diferencia entre ITS1 y ITS2

ITS1 es un ADN espaciador presente entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador presente entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas. Entonces, esta es la principal diferencia entre ITS1 e ITS2. Además, ITS1 muestra una mayor variación de longitud en comparación con ITS2. Por otro lado, ITS2 tiene una variación de longitud más corta en comparación con ITS1. Esta es otra diferencia entre ITS1 e ITS2.

La siguiente infografía enumera las diferencias entre ITS1 e ITS2 en forma tabular para una comparación directa.

Resumen: ITS1 frente a ITS2

La región transcrita interna (ITS) es una pieza no funcional de ADN espaciador ubicada entre los genes de ARNr. En bacterias y arqueas solo hay una única región ITS. Pero en eucariotas hay dos regiones ITS: ITS1 e ITS2. ITS1 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 18S y 5.8S en eucariotas, mientras que ITS2 es un ADN espaciador ubicado entre los genes de ARNr 5.8S y 28S en eucariotas. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre ITS1 e ITS2.

Relación:

1. “Espaciador transcrito interno”. Una visión general | Temas de ScienceDirect.
2. Schoch, Conrad L., et al. "La región del espaciador transcrito interno ribosomal nuclear (ITS) como un marcador de código de barras de ADN universal para hongos." PNAS, Academia Nacional de Ciencias.

Imagen de cortesía:

1. "Eukaryot rdna" Por - Creía el faraón Han - No se proporciona una fuente legible por máquina. Trabajo propio asumido (basado en reclamos de derechos de autor) (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "MolecularMarkersSymbiodinium" por Allisonmlewis - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia