Diferencia entre enlazador y adaptador.

Que diferencia principal entre el enlazador y el adaptador es que Un enlazador no tiene extremos adhesivos, mientras que un adaptador tiene un extremo adhesivo.

La ligadura de ADN es el proceso de unir dos moléculas de ADN, formando enlaces fosfodiéster. La enzima llamada ADN ligasa cataliza esta reacción. Es uno de los pasos cruciales en los campos de la biología molecular moderna, como la tecnología de ADN recombinante y la clonación de ADN. La eficacia de la ligadura depende de los extremos de las moléculas de ADN a ligar. Hay dos tipos de extremos de ADN como extremos pegajosos y extremos romos. La eficiencia de la ligadura es mayor con los extremos pegajosos que con los extremos romos. Cuando las moléculas de ADN objetivo tienen extremos romos, las moléculas llamadas adaptadores o enlazadores son útiles. Los adaptadores y enlazadores son moléculas de oligonucleótidos sintetizados químicamente que ayudan en la ligadura del ADN. También tienen sitios de restricción internos. El adaptador tiene un extremo pegajoso y un extremo romo, mientras que el conector tiene dos extremos romos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es un enlazador?
3. ¿Qué es un adaptador?
4. Similitudes entre el enlazador y el adaptador
5. Comparación lado a lado: enlazador frente a adaptador en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es un enlazador?

Linker es una secuencia de oligonucleótidos sintetizada químicamente que es de doble cadena. Linker tiene dos extremos romos. Los enlazadores se utilizan para ligar moléculas de ADN de extremos romos a vectores. Contiene uno o más sitios de restricción internos. Estos sitios de restricción actúan como sitios de reconocimiento para las enzimas de restricción.

Figura 01: Enlazador

Después de la ligadura, el ADN se restringe nuevamente con enzimas de restricción para crear extremos cohesivos. Los enlazadores EcoRI y los enlazadores Sal I son enlazadores comúnmente usados.

¿Qué es un adaptador?

Un adaptador es una secuencia de oligonucleótidos de doble cadena que se utiliza para unir dos moléculas de ADN. Es una secuencia corta con un final romo y un final pegajoso o cohesivo. Por lo tanto, consta de una cola monocatenaria en un extremo, lo que aumenta la eficiencia de la ligadura del ADN.

Figura 02: ligadura de ADN por un adaptador

Además, el adaptador tiene sitios de restricción internos. Por lo tanto, después de la ligadura, el ADN puede restringirse con enzimas de restricción apropiadas para crear un nuevo extremo saliente. Una desventaja de los adaptadores es que dos adaptadores pueden formar atenuadores mediante el emparejamiento de bases entre sí. Esto se puede evitar tratándolos con la enzima fosfatasa alcalina.

¿Cuáles son las similitudes entre el enlazador y el adaptador?

• Tanto los enlazadores como los adaptadores son secuencias de oligonucleótidos cortas de doble cadena.
• Llevan sitios de restricción internos.
• Además, son moléculas de ADN sintetizadas químicamente y moléculas sintéticas.
• Pueden unir dos moléculas de ADN.
• Después de la ligadura de los enlazadores y adaptadores, el ADN se restringe nuevamente con enzimas de restricción para crear extremos cohesivos.

¿Cuál es la diferencia entre el enlazador y el adaptador?

Un enlazador es un dúplex de oligonucleótidos corto sintetizado químicamente con dos extremos romos. Un adaptador es un dúplex de oligonucleótidos corto sintetizado químicamente con un extremo pegajoso y un extremo romo. Entonces, esta es la diferencia clave entre el enlazador y el adaptador. Además, los adaptadores pueden formar dímeros mientras que los enlazadores no forman dímeros. Entonces, esta es otra diferencia clave entre el enlazador y el adaptador.

A continuación se muestra una tabla que resume las diferencias entre el enlazador y el adaptador.

Resumen - Enlazador vs. Adaptador

Los enlazadores y adaptadores son dos tipos de oligonucleótidos sintetizados químicamente útiles para ligar ADN de extremos romos. Linker tiene dos extremos romos, mientras que el adaptador tiene un extremo romo y un extremo cohesivo. Entonces, esta es la diferencia clave entre el enlazador y el adaptador. Son moléculas de doble cadena con sitios de restricción internos. Se utilizan comúnmente en la tecnología de ADN recombinante y la clonación de ADN.

Relación:

1. "ADN enlazador". Wikipedia, Fundación Wikimedia, 31 de agosto de 2020, disponible aquí.
2. Rothstein, RJ, et al. "[7] Adaptadores sintéticos para la clonación de ADN.” Métodos en Enzimología, Academic Press, 7 de enero de 2004, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Flujo de trabajo BLESS (Actualización v2)" por Karahavet - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. “Preparación de la biblioteca para la plataforma SOLiD” por Philippe Hupé – Emmanuel Barillot, Laurence Calzone, Philippe Hupé, Jean-Philippe Vert, Andrei Zinovyev, Computational Systems Biology of Cancer Chapman & Hall/CRC Mathematics & Computational Biology, 2012 (CC BY -SA 3.0) a través de Commons Wikimedia