Diferencia entre gen candidato y GWAS

 

Que diferencia principal entre el gen candidato y GWAS es que El enfoque del gen candidato examina la variación genética dentro de un pequeño número de genes de interés predefinidos, mientras que GWAS examina el genoma completo en busca de una variación genética común detrás de un estado de enfermedad específico.

El enfoque del gen candidato y los estudios de asociación del genoma completo (GWAS) son dos métodos que son importantes para detectar la susceptibilidad genética a la enfermedad. El enfoque del gen candidato se basa en un pequeño número predeterminado de genes, mientras que GWAS se basa en probar todo el genoma. Por lo tanto, a diferencia de GWAS, el enfoque del gen candidato requiere un conocimiento previo de los genes relacionados con la enfermedad.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es un gen candidato?
3. ¿Qué es GWAS?
4. Similitudes entre el gen candidato y GWAS
5. Comparación lado a lado: gen candidato frente a GWAS en forma tabular
6. Resumen

Índice temático
  1. CONTENIDO
  • ¿Qué es un gen candidato?
  • ¿Qué es GWA?
  • ¿Cuáles son las similitudes entre el gen candidato y GWAS?
  • ¿Cuál es la diferencia entre el gen candidato y GWAS?
  • Resumen: gen candidato frente a GWAS
  • ¿Qué es un gen candidato?

    El enfoque del gen candidato es una de las técnicas que examina la asociación entre la variación genética dentro de los genes de interés predefinidos y los fenotipos o estados patológicos. Este enfoque requiere un conocimiento previo de las implicaciones funcionales biológicas del gen para el rasgo o enfermedad de interés. Con base en este conocimiento, se selecciona y analiza una pequeña cantidad de genes para determinar la variación genética.

    Diferencia clave: gen candidato frente a GWAS

    Figura 01: enfoque del gen candidato

    En este enfoque, los genes se seleccionan sobre la base de su relevancia biológica, fisiológica y funcional para la enfermedad respectiva. Este enfoque a menudo se diseña como un estudio de casos y controles.

    ¿Qué es GWA?

    GWAS significa Estudio de asociación de todo el genoma. También se relaciona con los estudios de asociación del genoma completo. Estos estudios se centran principalmente en estudios observacionales. Analizan las variantes genéticas de diferentes individuos que suelen estar asociadas a un rasgo concreto. El genoma completo es importante para el análisis GWAS.

    GWAS es una herramienta importante en el análisis de polimorfismos de un solo nucleótido asociados con varios estados de enfermedad. Es un estudio comparativo de los diferentes polimorfismos de un solo nucleótido en una población amplia. La muestra de estudio del GWAS es muy grande; por lo tanto, también toma el formato de un estudio transversal de cohortes.

    Diferencia entre gen candidato y GWAS

    Figura 02: GWAS

    El primer estudio GWAS tuvo lugar sobre el tema del infarto de miocardio y sobre el análisis de los genes asociados al infarto de miocardio. Actualmente, GWAS juega un papel importante en la determinación de los antecedentes genéticos de enfermedades complejas de etiología desconocida.

    ¿Cuáles son las similitudes entre el gen candidato y GWAS?

    • Tanto el enfoque del gen candidato como el GWAS son técnicas que analizan la asociación genética entre el genotipo y el fenotipo de la enfermedad.
    • Ambos enfoques ayudan a comprender la base genética de la susceptibilidad a la enfermedad.

    ¿Cuál es la diferencia entre el gen candidato y GWAS?

    El enfoque del gen candidato se basa en los genes candidatos o genes predeterminados, mientras que GWAS se basa en el genoma completo. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el gen candidato y GWAS. Además, la selección de genes es necesaria en el enfoque de genes candidatos, mientras que no se requiere en GWAS.

    Además, el enfoque del gen candidato requiere un conocimiento previo de los genes relevantes para la enfermedad, mientras que esto no es necesario para GWAS.

     

    Resumen: gen candidato frente a GWAS

    El gen candidato y el GWAS son dos estudios de asociación de genes. El enfoque del gen candidato se centra en la variación genética asociada con la enfermedad dentro de un pequeño conjunto de genes predefinidos. GWAS, por otro lado, examina la variación genética asociada con la enfermedad a lo largo del genoma. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el gen candidato y GWAS. Ambos métodos son importantes para comprender la base genética de la susceptibilidad a la enfermedad.

    Relación:

    1. "Genes candidatos: descripción general | Temas de Sciencedirect”. Sciencedirect.Com, 2020, disponible aquí.
    2. "Gen candidato". En.Wikipedia.Org, 2020, Disponible aquí.

    Imagen de cortesía:

    1. "Ranking-Candidate-Disease-Genes-from-Gene-Expression-and-Protein-Interaction-A-Katz-Centrality-pone.0024306.g001" Por Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P - archivo de imagen de Zhao J, Yang T, Huang Y, Holme P (2011). "Clasificación de candidatos a enfermedades a partir de la expresión génica y la interacción de proteínas: un enfoque basado en la centralidad de Katz". MAS UNO. DOI:10.1371/journal.pone.0024306. PMID 21912686. PMC: 3166320 (CC BY 3.0) a través de Commons Wikimedia
    2. "Manhattan Plot" de M. Kamran Ikram et al - Ikram MK et al (2010) Cuatro nuevos loci (19q13, 6q24, 12q24 y 5q14) afectan la microcirculación in vivo. PLoS Genet. 2010 28 de octubre; 6 (10): e1001184. doi:10.1371/journal.pgen.1001184.g001 (CC BY 2.5) vía Commons Wikimedia

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