Diferencia entre acoplamiento molecular y puntuación

15 de junio de 2020 Escrito por Madu

Que diferencia principal entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que El acoplamiento es una técnica para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso para evaluar una pose particular contando el número de interacciones intermoleculares favorables..

Los términos acoplamiento molecular y puntuación se utilizan en el campo del modelado molecular. El modelado molecular es una técnica utilizada para determinar los posibles arreglos de diferentes moléculas en una sustancia determinada. Esta técnica es importante para crear nuevas conexiones estables.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es el acoplamiento molecular?
3. ¿Qué es la puntuación molecular?
4. Comparación lado a lado: acoplamiento molecular frente a puntuación en forma tabular
5. Resumen

¿Qué es el acoplamiento molecular?

El acoplamiento molecular es una simulación por computadora de la unión de un ligando candidato a un receptor. Este método predice la orientación preferida de una molécula a otra molécula cuando se unen para formar un complejo estable. Los resultados obtenidos con esta técnica se pueden utilizar para predecir la fuerza de asociación o la afinidad de unión entre dos moléculas. La función de puntuación molecular también es importante aquí.

Figura 01: Un diagrama simple que muestra el proceso de interacciones moleculares en sistemas biológicos.

En general, esta técnica tiene en cuenta las moléculas biológicamente relevantes, como proteínas, péptidos, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos. Estas moléculas son muy importantes y juegan un papel importante en los mecanismos de transducción de señales en nuestro cuerpo. Por lo tanto, la orientación de las dos moléculas que se unirán para este proceso de transducción de señales afecta el tipo de señal generada aquí. Eso significa; El acoplamiento molecular es importante para determinar tanto la fuerza como la naturaleza de la señal generada durante la transducción de señales en los sistemas biológicos.

Además, las técnicas de acoplamiento molecular son importantes para el desarrollo de fármacos basados ​​en estructuras. Esto se debe a su previsibilidad de la conformación de unión de moléculas pequeñas tales como ligandos a un sitio de unión apropiado.

¿Qué es la puntuación molecular?

La puntuación molecular es un tipo de función matemática útil para evaluar el progreso del acoplamiento molecular. En el campo de la química computacional, las funciones de puntuación se utilizan para predecir la afinidad de unión entre dos moléculas después del proceso de acoplamiento. Por ejemplo, si tenemos una molécula pequeña de un fármaco de partículas y hay un objetivo biológico como una proteína, podemos evaluar la afinidad del fármaco por el sitio de unión. Además, la puntuación molecular se puede utilizar para predecir las interacciones intermoleculares entre dos proteínas o entre una proteína y moléculas de ADN.

Figura 02: función de puntuación en resumen

La principal aplicación de la puntuación molecular se encuentra en los procesos de diseño de fármacos, por ejemplo, la detección virtual, el diseño de novo, la optimización de prospectos, etc.

¿Cuál es la diferencia entre acoplamiento molecular y puntuación?

El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. los diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose específica contando el número de interacciones intermoleculares favorables.

La siguiente infografía resume la diferencia entre el acoplamiento molecular y la puntuación.

Resumen: acoplamiento molecular frente a puntuación

El acoplamiento y la puntuación moleculares son importantes en el modelado molecular. los diferencia clave entre el acoplamiento molecular y la puntuación es que el acoplamiento es una técnica utilizada para determinar la afinidad de unión entre dos moléculas, mientras que la puntuación es un proceso de evaluación de una pose específica contando el número de interacciones intermoleculares favorables.

Relación:

1. "Acoplamiento (Molecular)". Acoplamiento (molecular): descripción general | Temas de ScienceDirect, disponibles aquí.
2. Dar, Ayaz Mahmud. "Acoplamiento molecular: enfoques, tipos, aplicaciones y desafíos fundamentales". OMICS International, OMICS International, 27 de marzo de 2017, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Apariencia de acoplamiento 2" por Scigenis - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Scoringfunction" de Poulamibarman en Wikilibros en inglés - Transferido de en.wikibooks a Commons por Adrignola usando CommonsHelper (Dominio público) a través de Commons Wikimedia