¿Cuál es la diferencia entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice?

Que diferencia principal entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice es que hélice-bucle-hélice media la dimerización de proteínas, mientras que hélice-giro-hélice regula la expresión génica a través de la unión al ADN.

Un motivo proteico es una secuencia corta conservada asociada con diferentes funciones del ADN. Se asocia principalmente con un sitio estructural específico con una función química o biológica única. Estos motivos contienen pequeñas áreas de estructuras tridimensionales de aminoácidos con diferentes moléculas de proteína. Los motivos individuales suelen contener solo unos pocos elementos. Helix-Loop-Helix y Helix-Turn-Helix contienen tres elementos. Sus motivos estructurales de proteínas incluyen bucles de diferentes longitudes y estructuras no especificadas.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es Helix-Loop-Helix?
3. ¿Qué es Helix-Turn-Helix?
4. Similitudes - Helix-Loop-Helix y Helix-Turn-Helix
5. Helix-Loop-Helix vs. Helix-Turn-Helix en forma tabular
6. Resumen: hélice-bucle-hélice frente a hélice-giro-hélice

¿Qué es Helix Loop Helix?

Una hélice-bucle-hélice (HLH) es un motivo estructural de proteína que define una de las familias más grandes de factores de transcripción dimerizantes. Estos factores de transcripción contienen residuos de aminoácidos para facilitar el mecanismo de unión al ADN y son diméricos. El motivo estructural de la proteína contiene dos hélices α conectadas por un bucle. Una hélice parece ser la más pequeña de las dos hélices, y la flexibilidad del bucle permite la dimerización empaquetándose y plegándose contra otra hélice. La hélice, que parece más grande, suele contener regiones de unión al ADN. Las proteínas HLH se unen a una secuencia de consenso conocida como caja E. Una secuencia consenso es un orden calculado que contiene residuos de nucleótidos o aminoácidos. E-box es un elemento que responde al ADN en algunos eucariotas, que actúa como un sitio de unión a proteínas y regula la expresión génica.

Figura 01: Helix Loop Helix Motif

Los factores de transcripción HLH son esenciales para el desarrollo y la actividad celular. Las proteínas HLH pertenecen principalmente a seis grupos, indicados con las letras A a F. Los factores de transcripción incluidos en cada grupo son:

Grupo A: MyoD, Myf5, Beta2/NeuroD1, Scl, p-CaMK, NeuroD y neurogeninas,

Grupo B: MAX, C-Myc, N-Myc y TCF4

Grupo C: AhR, BMAL-1-CLOCK, HIF, NPAS1, NPAS3 y MOP5

grupo D; CEM

Grupo E: HEY1 y HEY2

Grupo F: EBF1

Debido a que la mayoría de los factores de transcripción de HLH son heterodiméricos, a menudo están regulados por dimerización.

¿Qué es hélice vuelta hélice?

Helix-turn-helix (HTH) es un motivo estructural de proteína capaz de unirse al ADN. Cada monómero está organizado con dos hélices α y está conectado por una cadena corta de aminoácidos. Esto se une a un surco en la hélice del ADN. Los motivos HTH normalmente regulan la expresión génica. El reconocimiento de HTH y la unión al ADN se produce a través de dos hélices α. Una hélice ocupa el N-terminal mientras que la otra está en el C-terminal. En la mayoría de los escenarios, la hélice se encarga de reconocer el ADN. Por lo tanto, se conoce como la hélice de reconocimiento. La unión al surco en el ADN ocurre a través de una serie de interacciones de van der Waals y enlaces de hidrógeno con bases expuestas. La otra hélice α estabiliza la interacción entre la proteína y el ADN y no juega un papel importante en el reconocimiento. Sin embargo, la hélice de detección y la hélice restante tienen una orientación similar.

Figura 02: familia TetR hélice-giro-hélice

El HTH se clasifica según la estructura y disposición espacial de las hélices. Los tipos principales son HTH dihelico, trihelico, tetrahelico y alado. El tipo di-helicoidal es el tipo más simple con dos hélices y un dominio de proteína plegable independiente. El tipo trihelicoidal se encuentra en el activador de transcripción Myb. El tipo tetrahelicoidal tiene una hélice C-terminal adicional. Finalmente, el HTH alado está formado por un haz de 3 hélices y una lámina beta de 3 o 4 hebras.

¿Cuáles son las similitudes entre Helix-Loop-Helix y Helix-Turn-Helix?

• Helix-loop-helix y helix-turn-helix son motivos estructurales de proteínas.
• Ambos tienen un denominador común en factores de transcripción basales y específicos.
• Están presentes en eucariotas.

¿Cuál es la diferencia entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice?

Helix-loop-helix media la dimerización de proteínas, mientras que helix-turn-helix regula la expresión génica a través de la unión al ADN. Entonces, esta es la diferencia clave entre helix-loop-helix y helix-turn-helix. Además, HLH contiene ciertos protooncogenes y genes involucrados en la diferenciación que codifican factores de transcripción, mientras que HTH contiene muchos genes homeóticos que codifican factores de transcripción. Además, hélice-bucle-hélice consiste principalmente en hélices alfa conectadas por un bucle, mientras que hélice-giro-hélice consiste principalmente en bucles conectados por un soporte de aminoácido corto que forma un surco.

La siguiente infografía muestra las diferencias entre helix-loop-helix y helix-turn-helix en forma tabular para una comparación directa..

Resumen: hélice-bucle-hélice frente a hélice-giro-hélice

Un motivo proteico es una secuencia corta conservada asociada con diferentes funciones del ADN. Helix-loop-helix y helix-turn-helix son dos tipos de motivos estructurales de proteínas. los diferencia principal entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice es que hélice-bucle-hélice media la dimerización de proteínas, mientras que hélice-giro-hélice regula la expresión génica a través de la unión al ADN. HLH es un motivo estructural de proteína que define una de las familias más grandes de factores de transcripción dimerizantes. El motivo estructural de la proteína contiene dos hélices α conectadas por un bucle. HTH es un motivo estructural de proteína capaz de unirse al ADN. Cada monómero está organizado con dos hélices α y está unido por una hebra de aminoácido corta y se une a un surco en la hélice de ADN. Así que esto resume la diferencia entre hélice-bucle-hélice y hélice-giro-hélice.

Relación:

1. "Hélice-bucle-hélice básica". Una visión general | Temas de ScienceDirect.
2. "Hélice-giro-hélice". Una visión general | Temas de ScienceDirect.

Imagen de cortesía:

1. "Hélice de bucle de hélice básica" Por I, Splette (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Alineación HTH de 3 miembros de la familia TetR" por Gabbiochem - utilizando PyMol basado en PDB: 5DY0 depositado por Palanca & Rubio, PDB: 3VIB depositado por Kumaraswami, Shafer, "Brennan y PDB: 3ZQL depositado por Le, Schumacher , Lawson, Brennan”; Buttner (CC BY 3.0) a través de Commons Wikimedia