Diferencia entre CDS y ORF

Una cuestión común en genética es entender qué es CDS en genética y cómo se diferencia de un ORF. La diferencia principal entre CDS y ORF es que el CDS, o secuencia de codificación, es la secuencia de nucleótidos real de un gen que se traduce en una proteína, mientras que el ORF, o marco de lectura abierto, es una porción de una secuencia de ADN que comienza con el sitio de inicio de la traducción (codón de inicio) y termina con un sitio de terminación de la traducción (codón de terminación).

El concepto de CDS genética es fundamental para comprender cómo se expresan los genes y cómo se forman las proteínas. Un gen tiene una secuencia codificante (CDS). Consiste en todos los exones del gen y un codón de inicio y un codón de terminación. Es la parte real del gen que traduce y produce la proteína. El marco de lectura abierto u ORF es una secuencia de nucleótidos ubicada entre un codón de inicio y un codón de terminación. No hay un codón de parada dentro de un ORF que interrumpa el código genético que se traduce en una proteína. En procariotas, el CDS y el ORF de un gen son los mismos, lo que simplifica la comprensión de la expresión génica en estos organismos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es CDS?
3. ¿Qué es el ORF?
4. Similitudes entre CDS y ORF
5. Comparación lado a lado - CDS vs. ORF en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es CDS?

CDS o secuencia de codificación es la parte del gen que en realidad se traduce en una proteína. Consiste en exones y dos codones conocidos como el codón AUG y el codón de parada. CDS no contiene dos regiones no traducidas: 5'UTR y 3"UTR. Además, los intrones no están contenidos en CDS.

Figura 01: Secuencia de codificación

En comparación con el genoma completo de un individuo, las secuencias de codificación son una pequeña fracción. La secuencia de codificación consta de la secuencia de nucleótidos necesaria para crear la secuencia de aminoácidos de la proteína. Por lo tanto, los CDS son exones concentrados que se pueden dividir en codones o tripletes de nucleótidos. Los aminoácidos se forman a partir de codones.

¿Qué es un ORF?

El marco de lectura abierto u ORF es el tramo continuo de la secuencia de nucleótidos que comienza con un codón de inicio y termina con un codón de terminación. En términos simples, ORF se refiere a la región de la secuencia de nucleótidos que se encuentra entre los codones de inicio y finalización. No hay un codón de parada intermedio que interrumpa el ORF. La secuencia de nucleótidos entre el codón de inicio y el de finalización codifica los aminoácidos. En general, el codón de inicio es ATG, mientras que los codones de finalización son TAG, TAA y TGA. ORF da lugar a una proteína funcional cuando se transcribe y traduce. Por lo tanto, ORF contiene un codón de inicio, varios codones de la región media y un codón de terminación. Curiosamente, el ORF tiene una longitud que es divisible por tres.

Figura 02: Marco de lectura abierto

Debido a que no hay intrones en los procariotas, ORF es la secuencia de codificación de un gen que se transcribe directamente en ARNm. Por lo tanto, CDS y ORF son iguales en procariotas. Al buscar genes en procariotas, es fácil reconocer un ORF y encontrar un gen en procariotas. Debido a que los intrones están presentes en los eucariotas, ORF es la secuencia de codones que se forma después del procesamiento o empalme del ARN. ORF es una evidencia que respalda la predicción de genes siempre que ORF sea probablemente parte de un gen.

¿Cuáles son las similitudes entre CDS y ORF?

• En procariotas, CDS y ORF son lo mismo.
• Ambos tienen un codón de inicio y un codón de terminación.
• Tienen un número de nucleótidos divisible por tres.
• Una vez que se traducen, producen secuencias de aminoácidos.

¿Cuál es la diferencia entre CDS y ORF?

CDS es la parte real del gen que se traduce en una proteína, mientras que ORF es el tramo de ADN entre un codón de inicio y un codón de terminación. Entonces esta es la principal diferencia entre CDS y ORF. Además, CDS no contiene intrones, pero ORF puede contener intrones. CDS se transcribe completamente en una secuencia de ARNm completa, mientras que ORF puede ser parte de la secuencia de ARNm. Esta es otra diferencia entre CDS y ORF.

Al comparar orf vs cds, es esencial destacar que todos los CDS son ORF, pero no todos los ORF son CDS. Esta distinción es crucial y a menudo es un punto de confusión en la genética molecular. La siguiente infografía enumera las diferencias entre CDS y ORF una al lado de la otra.

Resumen: CDS frente a ORF

CDS y ORF son dos partes importantes de un gen. CDS se refiere a la región real de ADN que se traduce en una proteína. ORF es una secuencia de ADN que comienza con el codón de inicio "ATG" y termina con uno de los tres codones de terminación (TAA, TAG o TGA). ORF puede ser parte del ARNm completo de un gen. Sin embargo, la secuencia codificante de un gen se transcribe en una secuencia completa de ARNm. Todos los CDS son ORF. Pero no todos los ORF son CDS. Por lo tanto, esto resume la diferencia entre CDS y ORF.

Relación:

1. "Marco de lectura abierto". Wikipedia, Fundación Wikimedia, 27 de noviembre de 2020, disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Región de codificación en el ADN" por Pragpats - Trabajo propio (CC BY-SA 4.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Sampleorf" por Luongdl - Trabajo propio (Dominio público) a través de Commons Wikimedia