Diferencia entre cebador y promotor.

Que diferencia principal entre cebador y promotor es que El cebador es una secuencia de ADN corta sintetizada comercialmente que se utiliza en PCR para amplificar una secuencia de ADN objetivo, mientras que el promotor es una secuencia de ADN específica que proporciona un sitio de unión inicial seguro para la ARN polimerasa. factores de transcripción para iniciar la transcripción.

El cebador y el promotor son dos tipos de secuencias de ADN. El cebador es un pequeño fragmento de ADN necesario para la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Tiene secuencias de nucleótidos cortas que son complementarias al extremo flanqueante de la hebra de ADN. Hay dos tipos de cebadores que sirven como puntos de partida para sintetizar nuevas hebras de ADN. Por el contrario, un promotor es una secuencia de ADN específica ubicada cadena arriba del sitio de inicio de la transcripción de un gen. Interactúa directamente con los componentes del mecanismo de transcripción como la ARN polimerasa y los factores de transcripción para controlar la transcripción del ADN. Por lo tanto, la ARN polimerasa y otros factores de transcripción se unen a la secuencia promotora e inician la transcripción.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es una cartilla?
3. ¿Qué es un promotor?
4. Similitudes entre cebador y promotor
5. Comparación lado a lado: cebador frente a promotor en forma tabular
6. Resumen

¿Qué es una imprimación?

Los cebadores son secuencias de ADN cortas diseñadas para la amplificación de secuencias de ADN diana. Estructuralmente, tienen secuencias de nucleótidos cortas que son complementarias a los extremos flanqueantes de los dúplex de ADN. Por lo general, tienen alrededor de 20 nucleótidos de largo. Durante la PCR, la polimerasa Taq cataliza la adición de nucleótidos a la secuencia de nucleótidos ya existente. Por lo tanto, los cebadores sirven como puntos de partida para la síntesis de nuevas hebras. La polimerasa Taq solo funciona en la dirección 5'-3'. Por lo tanto, la síntesis de ADN también ocurre en la misma dirección 5' a 3'. Debido a que el ADN es de doble cadena, se necesitan dos tipos de cebadores en la PCR. Se conocen como cebadores directos y cebadores inversos según la dirección de elongación del cebador durante la síntesis de ADN.

El cebador directo se hibrida con la hebra de ADN antisentido e inicia la síntesis de la hebra + del gen en la dirección 5' a 3'. Tiene una secuencia de nucleótidos corta complementaria al extremo 3' flanqueante de la cadena antisentido. El cebador inverso se hibrida con la hebra sentido e inicia la síntesis de una hebra complementaria de la hebra codificante, que es una hebra del gen en la dirección 5'-3'. Por lo tanto, el cebador inverso está diseñado para ser complementario al extremo 3' de la cadena codificante. Tanto los cebadores inversos como los directos son importantes para producir de millones a miles de millones de copias de regiones específicas de ADN que son objetivo o de interés.

El promotor es una secuencia de ADN ubicada cadena arriba o en el extremo 5' del sitio de inicio de la transcripción de un gen. Proporciona un sitio de unión para la ARN polimerasa y ciertos elementos reguladores para iniciar la transcripción del gen. Es una secuencia reguladora que se requiere para activar o desactivar un gen. Hay una secuencia de nucleótidos específica en el promotor. Puede tener 100-1000 pares de bases. El promotor indica la dirección de la transcripción. También especifica la hebra de sentido que se va a transcribir.

Hay tres tipos de elementos promotores como promotor central, promotor proximal y promotor distal. El promotor central es la parte mínima del promotor necesaria para iniciar la transcripción. Es el más cercano al codón de inicio. La caja TATA es una región conservada que se encuentra en muchos promotores centrales eucarióticos. Se encuentra entre 25 y 35 pares de bases aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción. El promotor proximal está ubicado aguas arriba del promotor central. Por lo general, se ubica 250 pares de bases aguas arriba del codón de inicio y contiene elementos reguladores primarios. El promotor distal se ubica aguas arriba del promotor proximal y contiene elementos reguladores adicionales. Los promotores bacterianos tienen dos elementos de secuencia corta en sus promotores. TATAAT es la secuencia consenso ubicada en -10 del promotor bacteriano, mientras que TTGACA es la secuencia consenso en -35. Se conocen como el elemento -10 y el elemento -35.

• El cebador y el promotor son dos tipos de secuencias de ADN.
• Consisten en secuencias de nucleótidos.
• Tanto el cebador como el promotor son importantes para la expresión génica.

El cebador es una secuencia de nucleótidos corta diseñada para la amplificación del ADN objetivo. Por el contrario, el promotor es una secuencia de ADN reguladora específica que se encuentra cadena arriba del sitio de inicio de la transcripción de un gen. Por lo tanto, esta es la diferencia clave entre el cebador y el promotor. Los cebadores tienen una longitud de unos 20 pares de bases, mientras que los promotores pueden tener entre 100 y 1000 pares de bases. Funcionalmente, los cebadores sirven como secuencias de partida para la síntesis de nuevas cadenas, mientras que los promotores dirigen la transcripción de genes al proporcionar sitios de unión para la ARN polimerasa y otros factores de transcripción.

Además, un promotor se define como la dirección de la transcripción e indica la hebra sentido de un gen. Estructuralmente, el cebador es una secuencia corta de ADN monocatenario mientras que el promotor es una secuencia larga de ADN bicatenario.

La siguiente infografía tabula comparaciones adicionales con respecto a la diferencia entre el cebador y el promotor.

Resumen: cebadores frente a promotores

Los cebadores son secuencias de nucleótidos cortas que son complementarias a los extremos flanqueantes del dúplex de ADN diana. En la PCR se utilizan dos tipos de cebadores. Sirven como secuencias de partida para la síntesis de nuevas hebras. Los cebadores se desarrollan comercialmente y son secuencias estables a la temperatura. Por otro lado, el promotor es una secuencia reguladora de un gen ubicado aguas arriba del sitio de inicio de la transcripción. Los promotores controlan la transcripción de genes. Proporcionan sitios de unión para la ARN polimerasa y los factores de transcripción para iniciar la transcripción. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre cebador y promotor.

Relación:

1. "Addgene: Promotores". Addgene.Org, 2020, disponible aquí.
2. "Imprimadores (biología molecular)". En.Wikipedia.Org, 2020, Disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Primers RevComp" de Zephyris - Trabajo propio (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Estructura del gen eucariota 2 anotada" Por Thomas Shafee - Shafee T, Lowe R (2017). "Estructura de genes eucarióticos y procarióticos". WikiRevista de Medicina 4 (1). DOI:10.15347/wjm/2017.002. ISSN 20024436 (CC BY 4.0) a través de Commons Wikimedia

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