Diferencia entre dNTP y DdNTP

Que diferencia principal entre dNTP y ddNTP es que dNTP o desoxirribonucleótidos son los componentes básicos del ADN y tienen un 3El grupo -OH en la estructura del azúcar pentosa, mientras que el ddNTP o los didesoxinucleósidos trifosfatos son nucleótidos que faltan. 3-OH y se utilizan en la técnica de secuenciación de ADN dideoxi de Sanger para producir secuencias de ADN de diferentes longitudes.

dNTP y ddNTP son nucleótidos. dNTP se refiere a nucleótidos de desoxirribosa. Son los componentes básicos del ADN. Los dNTP se utilizan para sintetizar ADN. dNTP, por otro lado, se refiere a trifosfatos de didesoxinucleósido. Se utilizan en la secuenciación de Sanger para detener la síntesis de ADN en diferentes longitudes. Carecen del grupo OH en la posición 3'. En la posición 3', hay un hidrógeno en lugar del grupo OH. Por lo tanto, los ddNTP no pueden formar un enlace fosfodiéster con el siguiente nucleótido. dNTP es capaz de realizar la síntesis de ADN mientras que ddNTP es capaz de terminar la polimerización de ADN.

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CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es dNTP?
3. ¿Qué es DdNTP?
4. Similitudes entre dNTP y DdNTP
5. Comparación lado a lado: dNTP frente a DdNTP en formato tabular
6. Resumen

¿Qué es dNTP?

dNTP significa nucleótido de desoxirribosa o desoxirribonucleótido. Es el componente básico del ADN. Hay cuatro tipos de dNTP. Son dATP, dTTP, dCTP y dGTP. Reciben su nombre de las bases nitrogenadas purina o pirimidina: adenina (A), guanina (G), timina (T) y citosina (C).

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Figura 01: dNTP

La adenina y la guanina son bases de purina, mientras que la timina y la citosina son bases de pirimidina. El azúcar pentosa de dNTP es desoxirribosa. También hay un grupo fosfato. Por lo tanto, dNTP consta de tres componentes: una base nitrogenada, azúcar desoxirribosa y un grupo fosfato. Estos dNTP se conectan entre sí a través de enlaces fosfodiéster. En los dNTP, un grupo OH está unido a la posición 3' del azúcar pentosa, que se requiere para formar un enlace con el grupo fosfato unido al átomo de carbono 5' del azúcar del siguiente nucleótido. Debido a que todos los dNTP tienen este grupo 3'-OH, pueden sintetizar y extender cadenas de ADN. Por lo tanto, dNTP funciona como la unidad básica de repetición del ADN y la materia química de los genes. La síntesis de ADN siempre procede de 5' a 3'.

¿Qué es DdNTP?

La secuenciación de Sanger es un método de secuenciación de ADN de primera generación desarrollado por Frederick Sanger y sus colegas en 1977. También se conoce como secuenciación de terminación de cadena o secuenciación didesoxi porque el principio básico de este método es la terminación de cadena utilizando trifosfatos de didesoxinucleósido (ddNTP). Los ddNTP son nucleótidos utilizados en la secuenciación de Sanger. La secuenciación de Sanger se basa en la incorporación selectiva de ddNTPs y la terminación de la síntesis de ADN durante la in vitro replicación del ADN. La peculiaridad de los ddNTP es que carecen del grupo 3'-OH en el azúcar pentosa para continuar la formación del enlace fosfodiéster entre el grupo fosfato de 5' en el nucleótido adyacente. Una vez que se une un ddNTP a la hebra extendida, el alargamiento de la cadena cesa y termina en ese punto. Los ddNTP actúan como inhibidores de la ADN polimerasa que alargan la cadena durante el método de secuenciación de Sanger.

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Figura 02: ddNTP

Hay cuatro ddNTP: ddATP, ddCTP, ddGTP y ddTTP utilizados en la secuenciación de Sanger. Estos nucleótidos detienen el proceso de replicación del ADN cuando se incorporan a la hebra de ADN en crecimiento. Como resultado, la secuenciación de Sanger produce ADN corto de longitudes variables. La electroforesis en gel capilar se utiliza para organizar estas hebras cortas de ADN según su tamaño en un gel. Los ddNTP se marcan de forma radiactiva o fluorescente con diferentes colores para facilitar el análisis de la secuencia de ADN. La secuencia de nucleótidos de la cadena de ADN desconocida se puede determinar analizando el gel.

¿Cuáles son las similitudes entre dNTP y DdNTP?

• Tanto dNTP como ddNTP se utilizan en la secuenciación de Sanger.
• Hay cuatro tipos de dNTP y ddNTP.
• Están formados por tres componentes: una base nitrogenada, azúcares desoxirribosa y grupos fosfato.

¿Cuál es la diferencia entre dNTP y DdNTP?

dNTP es uno de los cuatro tipos de desoxirribonucleótidos que son componentes básicos del ADN. ddNTP es uno de los cuatro tipos de didesoxirribonucleósido trifosfato utilizados en la técnica de secuenciación de Sanger. dNTP tiene un grupo 3'-OH en el azúcar pentosa mientras que ddNTP no tiene un grupo 3'-OH en el azúcar pentosa. Entonces, esta es la diferencia clave entre dNTP y ddNTP. Además, los dNTP realizan la polimerización del ADN mientras que los ddNTP terminan la polimerización del ADN. Por lo tanto, esta es otra diferencia clave entre dNTP y ddNTP.

La siguiente infografía enumera las diferencias entre dNTP y ddNTP en forma tabular.

Resumen: dNTP frente a DdNTP

Los dNTP normales son componentes básicos del ADN, mientras que los ddNTP son nucleótidos que se utilizan en la técnica de secuenciación de Sanger. dNTP tiene 3'-OH mientras que ddNTP carece de 3'-OH. Entonces, esta es la diferencia clave entre dNTP y ddNTP. Además, dNTP puede sintetizar una hebra de ADN mientras que ddNTP puede terminar la polimerización de ADN. Por lo tanto, los ddNTP se utilizan en la secuenciación de Sanger para crear diferentes hebras de ADN con diferentes longitudes. Tanto dNTP como ddNTP se incluyen durante la secuenciación de Sanger.

Relación:

1. "Dideoxinucleótido". Wikipedia, Fundación Wikimedia, 12 de julio de 2020, disponible aquí.
2. "Estructura y función del ADN". Lúmenes, Disponible aquí.

Imagen de cortesía:

1. "Desoxirribonucleótidos" por Par Bionet - Travail-Personal (CC0) a través de Commons Wikimedia

2. "Terminación didesoxi de la elongación del ADN EN" Por Michał Sobkowski - Trabajo propio (CC BY 3.0) a través de Commons Wikimedia