Diferencia entre NGS y WGS

Que diferencia principal entre NGS y WGS es que la secuenciación de próxima generación (NGS) es una tecnología de secuenciación masivamente paralela de segunda generación que es de alto rendimiento, económica y rápida, mientras que la secuenciación del genoma completo (WGS) es un método integral para analizar todo el ADN genómico de una célula. en un único punto de tiempo mediante el uso de técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento.

En las últimas décadas, la comprensión del genoma humano y de otros animales ha aumentado de manera espectacular debido al descubrimiento de técnicas de secuenciación rápida y herramientas bioinformáticas. Las técnicas de secuenciación tradicionales, como la secuenciación de Sanger, tenían limitaciones, lo que requería el desarrollo de nuevos métodos de secuenciación rápida, como la secuenciación de próxima generación (NGS) y la secuenciación de nanoporos. La técnica de secuenciación del genoma completo (WGS) es un nuevo enfoque que ya se utiliza en muchos proyectos de investigación del genoma, p. B. el proyecto de genómica 100,000 de Genomic England, Reino Unido. Entonces, NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que actualmente se están integrando en muchos proyectos genómicos.

CONTENIDO

1. Descripción general y diferencia clave
2. ¿Qué es NGS?
3. ¿Qué es WGS?
4. Similitudes - NGS y WGS
5. NGS vs. WGS en forma tabular
6. Resumen - NGS frente a WGS

¿Qué es NGS?

SNG (Secuenciación de última generación) es una tecnología de secuenciación paralela masiva de segunda generación con alto rendimiento, bajo costo y velocidad. No existe una definición precisa de secuenciación de próxima generación. Pero podemos distinguirlo claramente de las técnicas tradicionales de secuenciación capilar. La secuenciación de próxima generación permite la secuenciación de una molécula de ADN con un tamaño total de más de 1 millón de pares de bases en un solo experimento. Ofrece una velocidad sin precedentes y opciones de alto rendimiento, p. B. la secuenciación simultánea del ADN de varias personas. Esto se logra miniaturizando el volumen de las reacciones de secuenciación individuales. Además, esto también limita el tamaño de los instrumentos y minimiza el costo de los reactivos por reacción.

Figura 01: plataformas NGS

NGS es un método de secuenciación de lectura corta que ya ha revolucionado la investigación biológica. Además, NGS se utiliza en varios campos, como la secuenciación del genoma de novo, la secuenciación del genoma completo, el análisis de transcriptomas, la secuenciación de ARN pequeño y microARN, la resecuenciación dirigida y la secuenciación del exoma completo.

¿Qué es WGS?

WGS (secuenciación del genoma completo) es un método integral para analizar simultáneamente todo el ADN genómico de una célula utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento. También se conoce como secuenciación del genoma completo o secuenciación del genoma completo. La secuenciación del genoma completo implica la secuenciación de todo el ADN cromosómico de un organismo, así como el ADN en las mitocondrias y, en las plantas, el ADN en el cloroplasto en un solo punto en el tiempo. WGS permite a los científicos leer la secuencia exacta de cada letra que compone el conjunto completo de ADN. Se espera que la plataforma WGS con NGS revolucione la configuración clínica.

Figura 02: WGS vs secuenciación de escopeta jerárquica

La secuenciación del genoma completo se introdujo en la atención clínica en 2014. Además, la aplicación de WGS incluye la secuenciación de genes a nivel de SNP para localizar variantes funcionales en estudios de asociación, intervenciones terapéuticas en medicina personalizada, biología evolutiva, análisis genómico comparativo, estudios mutacionales y de reordenamiento, estudios de asociación de variantes raras y predicción de susceptibilidad a enfermedades y de respuesta a la medicación.

¿Cuáles son las similitudes entre NGS y WGS?

• NGS y WGS son dos técnicas de secuenciación.
• Ambas técnicas secuencian ADN o ARN.
• Estas técnicas son nuevas y fiables.
• Ambos se utilizan en el diagnóstico de enfermedades y el descubrimiento de fármacos.

¿Cuál es la diferencia entre NGS y WGS?

NGS es una tecnología de secuenciación paralela masiva de segunda generación que es de alto rendimiento, económica y rápida, mientras que WGS es un método integral para analizar simultáneamente todo el ADN genómico de una célula utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, enfoque de escopeta o Secuenciación NGS de alto rendimiento. Entonces, esta es la principal diferencia entre NGS y WGS. Además, NGS consta solo de métodos de secuenciación de segunda generación, mientras que WGS consta de métodos de secuenciación de primera, segunda y tercera generación.

La siguiente tabla muestra las diferencias entre NGS y WGS en forma tabular para una comparación directa.

Resumen: NGS frente a WGS

Varias técnicas de secuenciación se han aplicado de forma rutinaria en la investigación molecular moderna durante las últimas décadas. E incluso son herramientas muy poderosas para muchas aplicaciones clínicas. NGS y WGS son dos métodos de secuenciación que actualmente se están incorporando en muchos proyectos genómicos. NGS es una tecnología de secuenciación de segunda generación con alto rendimiento, bajo costo y velocidad. Por otro lado, WGS es un método para analizar el ADN genómico total o el ADN genómico completo de una célula en un único momento utilizando técnicas de secuenciación como la secuenciación de Sanger, el enfoque de escopeta o la secuenciación NGS de alto rendimiento. Entonces, este es el resumen de la diferencia entre NGS y WGS.

Relación:

1. Behjati, Sam y Patrick S. Tarpey. “¿Qué es la secuenciación de próxima generación?” Archivos de enfermedades infantiles. Edición de educación y práctica, BMJ Publishing Group.
2. "Secuenciación del genoma completo". Una visión general | Temas de ScienceDirect.

Imagen de cortesía:

1. "Secuenciación de segunda generación" por Chandra Shekhar Pareek, Rafal Smoczynski y Andrzej Tretyn - Journal of Applied Genetics - Volumen 52 - Número 4 (CC BY-SA 3.0) a través de Commons Wikimedia
2. "Secuenciación de escopeta del genoma completo versus secuenciación de escopeta jerárquica" Von Commins, J., Toft, C., Fares, MA - "Métodos de biología computacional y su aplicación a la genómica comparativa de bacterias simbióticas endocelulares de insectos" Biol. Online - procedimientos (2009). Acceso a través de SpringerImages. (CC BY-SA 2.5) a través de Commons Wikimedia