Lo más importante es ver compuestos relacionados con la estereoquímica, estos compuestos tienen la misma estructura química, pero existe una orientación espacial diferente. Este tipo de compuestos pueden considerarse impurezas en los ingredientes farmacéuticos activos. La quiralidad puede observarse en una molécula que contiene uno o más carbonos tetraédrico por cuatro sustancias diferentes. Las moléculas quirales también pueden deberse a muchas razones diferentes y deberían ser el factor en cualquier evaluación de impurezas. Las moléculas quirales se llaman a menudo enantiómeros. Los enantiómeros son isómeros ópticos con una estructura química similar, pero tienen una disposición espacial distinta.
Es importante que no los ignoren porque un isómero de compuesto puede tener una actividad toxicológica o farmacológica diferente, por tanto, el isómero óptico no deseado se considera impureza quiral de los ingredientes farmacéuticos activos. Además, es importante tener en cuenta que el número de impurezas quirales aumenta con el aumento del número de átomos de carbono asimétricos en la molécula.