La cromatografía en papel es un tipo de proceso de cromatografía que se utiliza para separar los compuestos. Es una técnica de cromatografía plana en la que un papel especial de celulosa actúa como fase estacionaria en la que las moléculas se separan. El principio implicado en la cromatografía en papel es una partición en la que los componentes se distribuyen o dividen en fases líquidas. El mismo principio básico (partición) implicado en la cromatografía en columna, la cromatografía líquida y la cromatografía de capa fina (TLC).
La fase estacionaria de la cromatografía en papel es el papel de celulosa, el polar y el agua también son bastante polares, por tanto no hay ninguna distinción para separar las moléculas. El agua no se utiliza en la cromatografía del papel, debido al agua el papel se hincha y finalmente se disuelve.