Existe un caudal de disolvente óptimo para cada columna, depende del tipo de fase móvil, analito y dimensión de la columna que se utiliza. Si el caudal de disolvente es demasiado rápido, no se está consiguiendo el tiempo adecuado para el equilibrio de los compuestos y se verá forzado a descender por la columna dejando una larga cola. Si el caudal de disolvente se utiliza muy lentamente en la cromatografía en columna, los procesos de difusión conducirán a la ampliación de la banda. Para columnas de menor diámetro, la tasa óptima es inferior a las columnas con mayor diámetro. Por tanto, en comparación con columnas más pequeñas, las columnas más grandes se pueden ejecutar con un caudal más alto.
Sabemos que el tamaño de las fracciones recogidas depende del valor Rf y del tamaño de la columna y que el caudal del disolvente puede afectar al proceso de separación. El caudal adecuado en la cromatografía de columna depende de las dimensiones de la columna. El principal efecto del caudal en la cromatografía en columna es que cambiar el caudal del análisis puede cambiar la calidad de separación del componente.
