La separación de sus componentes es un factor importante en la cromatografía líquida de alto rendimiento, para la que se utilizan la fase estacionaria y la móvil. La elección del tampón adecuado para el análisis cromatográfico de analitos depende del valor máximo, el rango de pH y las características del tampón para el corte UV. El valor de pH de la solución tampón o de la fase móvil utilizada con un valor de pKa de +/-1 molécula.
El tampón suele ser necesario cuando se analicen moléculas ionizables con RP-HPLC. Para compuestos como éstos, el pH de la fase móvil determina si están presentes en forma de ionizado o no ionizado. Esto crea una disparidad, puesto que las especies ionizadas siempre eluyen primero de la columna HPLC en la cromatografía de fase inversa. Si el pH del tampón o fase móvil cambia, el resultado será inconsistente. En ocasiones también se requieren tampones para las aplicaciones porque las impurezas o los compuestos interferentes son ionizantes. Si las impurezas o compuestos interferentes son ionizables, también se utilizan los tampones.