Las ventajas de la cromatografía de intercambio iónico son las siguientes.
- La cromatografía de intercambio iónico es uno de los métodos más potentes para separar partículas cargadas.
- Con este método también se pueden separar los iones inorgánicos.
- Puede utilizarse más habitualmente tanto con fines analíticos como preparativos.
- Casi todas las moléculas cargadas como pequeños aminoácidos, nucleótidos y proteínas grandes se pueden separar mediante este método.
- Éste es un método de suavización de agua muy eficaz y potente.
- Las resinas tienen una larga vida.
- Tiene un mantenimiento económico.
Las desventajas de la cromatografía de intercambio iónico son las siguientes.
- El requisito de tampón es la principal desventaja de la cromatografía de intercambio iónico.
- Tiene un alto coste de trabajo puesto que el buffer se utiliza para la separación de componentes.
- Este método sólo puede utilizarse para aislar moléculas cargadas.
- Los iones de sodio que entran en el agua suave aumentarán el nivel de acidez del agua.